Manisa ili; Osmanlı İmparatorluğu zamanında Saruhan Sancağı olarak idare yapısı içinde yer almış, 1923 yılında Cumhuriyetin ilanı ile birlikte Saruhan ili olarak teşkil edilmiş olup, müteakiben 1927 yılında isim değişikliği yapılarak Manisa adını almıştır.
1923 yılından itibaren şehir merkezinde çeşitli binalarda konuşlanan İl Jandarma Komutanlığı 1938 yılında istasyon karşısındaki şimdiki Merkez Komutanlığının bulunduğu binaya nakledilmiş ve 1985 yılına kadar bu binada konuşlanmıştır. Bu binanın 1985 yılında Merkez Komutanlığına devredilmesiyle birlikte şimdiki hizmet binasına taşınmıştır.
Manisa iline bağlı Akhisar, Alaşehir, Demirci, Kırkağaç, Kula, Salihli, Soma ve Turgutlu ilçeleri 1923 öncesi ilçe teşkilatı ile idare edildiklerinden Jandarma teşkilatları bu tarihten önce kurulmuştur. 1928 yılında Gördes’te, 1954‘ te Selendi’de, 1957’ de Sarıgöl’de, 1959’ da Saruhanlı’da, 1988’ de Gölmarmara ve Ahmetli’de, 1991 yılında Köprübaşı’nda ilçe teşkilatı kurulmasıyla birlikte, İlçe Jandarma Komutanlıkları da teşkil edilmiştir.